A method for removing a target DNA fragment having a predetermined
base-pair length from a mixture of DNA fragments comprises the following
steps. A mixture of DNA fragments which may contain the target DNA
fragments is applied to a separation column containing media having a
nonpolar, nonporous surface, the mixture of DNA fragments being in a first
solvent mixture containing a counterion and a DNA binding concentration of
driving solvent in a cosolvent. The target DNA fragments are separated
from the media by contacting it with a second solvent solution containing
a counterion and a concentration of driving solvent in cosolvent which has
been predetermined to remove DNA fragments having the target DNA fragment
base pair length from the media. The target DNA fragments can be collected
and optionally amplified. When the method is being applied to collect a
putative fragment, if present, no DNA fragments having the base pair
length of the target DNA could be present in the mixture. Alternatively,
DNA fragments having the base pair length of the target DNA are present in
the mixture. The disclosure also describes an ambient or low pressure
device for separating polynucleotide fragments from a mixture of
polynucleotide fragments comprises a tube having an upper solution input
chamber, a lower eluant receiving chamber, and a fixed unit of separation
media supported therein. The separation media has nonpolar separation
surfaces which are free from multivalent cations which would react with
counterion to form an insoluble polar coating on the surface of the
separation media.
Um método para remover um fragmento do DNA do alvo que tem um comprimento predeterminado do base-par de uma mistura de fragmentos do DNA compreende as seguintes etapas. Uma mistura dos fragmentos do DNA que podem conter os fragmentos do DNA do alvo é aplicada a uma coluna da separação que contem os meios que têm uma superfície nonpolar, nonporous, a mistura dos fragmentos do DNA que estão em uma primeira mistura solvente que contem um counterion e uma concentração obrigatória do DNA de dirigir o solvente em um cosolvent. Os fragmentos do DNA do alvo são separados dos meios contatando a com uma segunda solução solvente que contem um counterion e uma concentração de dirigir o solvente em cosolvent que foi predeterminado para remover os fragmentos do DNA que têm o comprimento do par da base do fragmento do DNA do alvo dos meios. Os fragmentos do DNA do alvo podem ser coletados e opcionalmente amplificado. Quando o método for aplicado para coletar um fragmento putative, se o presente, nenhuns fragmentos do DNA que têm o comprimento baixo do par do DNA do alvo poderia estar atual na mistura. Alternativamente, os fragmentos do DNA que têm o comprimento baixo do par do DNA do alvo estão atuais na mistura. A divulgação descreve também um ambiental ou o dispositivo da pressão baixa para separar fragmentos do polynucleotide de uma mistura de fragmentos do polynucleotide compreende um tubo que tem uma câmara superior da entrada da solução, um eluant mais baixo que recebem a câmara, e uma unidade fixa dos meios da separação suportados nisso. Os meios da separação têm as superfícies nonpolar da separação que estão livres dos cations multivalentes que reagiriam com o counterion ao formulário um revestimento polar insoluble na superfície dos meios da separação.