A method for the preparation of a fluorescence resonance energy transfer
(FRET) substrate having donor and acceptor species on opposite sides of a
proteolytic cleavage site and wherein the donor and/or acceptor species
are attached via the side chain(s) of amino acid(s) therein. The method
comprises contacting a reactive donor or acceptor species with a
polypeptide substrate having the side chain(s) of amino acid(s) therein
adapted for reaction with the reactive species and then contacting the
substrate so obtained with a corresponding reactive donor or acceptor
species. Novel FRET substrates so prepared and their use in assays to
identify modulators of protease activity.
Μια μέθοδος για την προετοιμασία ενός υποστρώματος ενεργειακής μεταφοράς αντήχησης φθορισμού (ΜΑΙΑΝΔΡΟΣ) που έχει τα είδη χορηγών και αποδεκτών στις αντίθετες πλευρές μιας proteolytic περιοχής σχισίματος και όπου τα είδη χορηγών ή/και αποδεκτών είναι συνημμένα μέσω της πλευρικής αλυσίδας (σ) του αμινοξέος (σ) εκεί μέσα. Η μέθοδος περιλαμβάνει την επαφή ενός αντιδραστικού είδους χορηγών ή αποδεκτών με ένα polypeptide υπόστρωμα που έχει την πλευρική αλυσίδα (σ) του αμινοξέος (σ) που προσαρμόζεται εκεί μέσα για την αντίδραση με τα αντιδραστικά είδη και έπειτα που έρχεται σε επαφή με το υπόστρωμα που λαμβάνεται έτσι με ένα αντίστοιχο αντιδραστικό είδος χορηγών ή αποδεκτών. Νέα υποστρώματα ΜΑΙΑΝΔΡΩΝ που προετοιμάζονται έτσι και η χρήση τους στις δοκιμές για να προσδιορίσει τους διαμορφωτές της δραστηριότητας πρωτεάσεων.