The invention provides arrays of immobilized probes, and methods employing
the arrays, for detecting mutations in the biotransformation genes, such
as cytochromes P450. For example, one such array comprises four probe
sets. A first probe set comprises a plurality of probes, each probe
comprising a segment of at least three nucleotides exactly complementary
to a subsequence of a reference sequence from a biotransformation gene,
the segment including at least one interrogation position complementary to
a corresponding nucleotide in the reference sequence. Second, third and
fourth probe sets each comprise a corresponding probe for each probe in
the first probe set. The probes in the second, third and fourth probe sets
are identical to a sequence comprising the corresponding probe from the
first probe set or a subsequece of at least three nucleotides thereof that
includes the at least one interrogation position, except that the at least
one interrogation position is occupied by a different nucleotide in each
of the four corresponding probes from the four probe sets.
Η εφεύρεση παρέχει τις σειρές ακινητοποιημένων ελέγχων, και τις μεθόδους υιοθετώντας τις σειρές, για την ανίχνευση των μεταλλαγών στα γονίδια βιολογικής μεταβολής, όπως τα κυτοχρώματα P450. Παραδείγματος χάριν, μια τέτοια σειρά περιλαμβάνει τέσσερα σύνολα ελέγχων. Ένα πρώτο σύνολο ελέγχων περιλαμβάνει μια πολλαπλότητα των ελέγχων, κάθε έλεγχος περιλαμβάνοντας ένα τμήμα τουλάχιστον τριών νουκλεοτιδών ακριβώς συμπληρωματικών σε ένα subsequence μιας ακολουθίας αναφοράς από ένα γονίδιο βιολογικής μεταβολής, το τμήμα συμπεριλαμβανομένης τουλάχιστον μιας θέσης ερώτησης συμπληρωματικής σε μια αντίστοιχη νουκλεοτίδα στην ακολουθία αναφοράς. Δεύτερον, ο τρίτος και τέταρτος έλεγχος θέτει κάθε ενός περιλαμβάνει έναν αντίστοιχο έλεγχο για κάθε έλεγχο στο πρώτο σύνολο ελέγχων. Οι έλεγχοι στα δεύτερα, τρίτα και τέταρτα σύνολα ελέγχων είναι ίδιοι με μια ακολουθία που περιλαμβάνει τον αντίστοιχο έλεγχο από το πρώτο σύνολο ελέγχων ή ένα subsequece τουλάχιστον τριών νουκλεοτιδών που επ' αυτού περιλαμβάνει την τουλάχιστον μια θέση ερώτησης, εκτός από το ότι η τουλάχιστον μια θέση ερώτησης καταλαμβάνεται από μια διαφορετική νουκλεοτίδα σε κάθε ένας από τους τέσσερις αντίστοιχους ελέγχους από τα τέσσερα σύνολα ελέγχων.