Methods and compounds, including compositions therefrom, are provided for determining the sequence of nucleic acid molecules. The methods permit the determination of multiple nucleic acid sequences simultaneously. The compounds are used as tags to generate tagged nucleic acid fragments which are complementary to a selected target nucleic acid molecule. Each tag is correlative with a particular nucleotide and, in a preferred embodiment, is detectable by mass spectrometry. Following separation of the tagged fragments by sequential length, the tags are cleaved from the tagged fragments. In a preferred embodiment, the tags are detected by mass spectrometry and the sequence of the nucleic acid molecule is determined therefrom. The individual steps of the methods can be used in automated format, e.g., by the incorporation into systems.

Os métodos e os compostos, including composições therefrom, são fornecidos determinando a seqüência de moléculas do ácido nucleic. Os métodos permitem a determinação de seqüências múltiplas do ácido nucleic simultaneamente. Os compostos são usados como os Tag para gerar etiquetaram os fragmentos do ácido nucleic que são complementares a uma molécula selecionada do ácido nucleic do alvo. Cada Tag é correlativo com um nucleotide particular e, em uma incorporação preferida, é detectável pelo spectrometry maciço. A separação seguindo dos fragmentos etiquetados pelo comprimento seqüencial, os Tag cleaved dos fragmentos etiquetados. Em uma incorporação preferida, os Tag são detectados pelo spectrometry maciço e a seqüência da molécula do ácido nucleic é determinada therefrom. As etapas individuais dos métodos podem ser usadas no formato automatizado, por exemplo, pela incorporação em sistemas.