A full-length feline immunodeficiency virus NCSU.sub.1 (FIV-NCSU.sub.1) genome (JSY3) was cloned directly from FIV-NCSU.sub.1 -infected feline CD4.sup.+ lymphocyte (FCD4E) genomic DNA and identified by PCR amplification with 5' long terminal repeat (LTR), gag, env, and 3' LTR primer sets. Cell-free JSY3 virus was cytopathogenic for FCD4E lymphocytes but did not infect CrFK cells in vitro. To determine in vivo infectivity and pathogenesis, six young adult specific-pathogen-free cats were inoculated with cell-free JSY3 virus. Provirus was detected at 2 weeks postinfection (p.i.) and was still detectable at 25 weeks p.i. as determined by gag region PCR-Southern blot analysis of peripheral blood mononuclear cell lysates. Infectious virus was recovered from peripheral blood mononuclear cells at 6 and 25 weeks p.i., and an antibody response to FIV was detected by 4 weeks. In the acute phase of infection, JSY3 provirus was found only in the CD4.sup.+ lymphocyte subset; however, by 14 weeks p.i., the greatest provirus burden was detected in B lymphocytes. All six cats were panlymphopenic at 2 weeks p.i., CD4+/CD8+ ratios were inverted by 6 weeks p.i., and five of the six cats developed lymphadenopathy by 10 weeks p.i. The claimed invention is directed toward isolated nucleic acids corresponding to the full-length JSY3 env coding region (nt. 6269-8824) and an env fragment comprising the transmembrane spanning domain (nt. 8339-8374). These nucleic acids will prove useful, inter alia, as molecular probes for FIV-specific sequences and in the generation of FIV-specific antigens and immunological reagents.

Ένα ολόκληρο αιλουροειδές γονιδίωμα ιών NCSU.sub.1 ανεπάρκειας αντισωμάτων (φηβ- NCSU.sub.1) (JSY3) κλωνοποιήθηκε άμεσα από φηβ- NCSU.sub.1 - μολυσμένος αιλουροειδής CD4.sup. + το genomic DNA λεμφοκυττάρων (FCD4E) και προσδιορισμένος από pcr την ενίσχυση με 5 "μακροχρόνιο τερματικό επαναλαμβάνει (ltr), φίμωμα, env, και 3" ltr σύνολα εγχυτήρων. Ο χωρίς κύτταρα JSY3 ιός ήταν κυτοπαθογενής για τα λεμφοκύτταρα FCD4E αλλά δεν μόλυνε τα κύτταρα CrFK in vitro. Για να καθορίσουν την in vivo μολυσματικότητα και την παθογένεση, έξι νέες ενήλικες συγκεκριμένος-παθογόνο-ελεύθερες γάτες εμβολιάστηκαν με το χωρίς κύτταρα JSY3 ιό. Provirus ανιχνεύθηκε σε 2 εβδομάδες postinfection (p.i.) και ήταν ακόμα ανιχνεύσιμο σε 25 εβδομάδες p.i. όπως καθορίζεται από την πθρ-νότια ανάλυση λεκέδων περιοχών φιμωμάτων του απομακρυσμένου μονοπύρηνου κυττάρου αίματος lysates. Ο μολυσματικός ιός ανακτήθηκε από τα απομακρυσμένα μονοπύρηνα κύτταρα αίματος σε 6 και 25 εβδομάδες p.i., και μια αντίδραση αντισωμάτων σε FIV ανιχνεύθηκε μέχρι 4 εβδομάδες. Στην οξεία φάση μόλυνσης, JSY3 provirus βρέθηκε μόνο CD4.sup. + το υποσύνολο λεμφοκυττάρων εντούτοις, μέχρι 14 εβδομάδες p.i., το μέγιστο provirus φορτίο ανιχνεύθηκε στα λεμφοκύτταρα β. Και οι έξι γάτες ήταν panlymphopenic σε 2 εβδομάδες p.i., CD4+/$l*CD8 + αναλογίες αναστράφηκε μέχρι 6 εβδομάδες p.i., και πέντε από τις έξι γάτες ανέπτυξαν lymphadenopathy μέχρι 10 εβδομάδες p.i. Η απαιτημένη εφεύρεση κατευθύνεται προς τα απομονωμένα νουκλεϊνικά οξέα που αντιστοιχούν στην ολόκληρη JSY3 env περιοχή κωδικοποίησης (nt. 6269-8824) και ένα env τεμάχιο περιλαμβάνοντας transmembrane που εκτείνεται την περιοχή (nt. 8339-8374). Αυτά τα νουκλεϊνικά οξέα θα αποδειχθούν χρήσιμα, μεταξύ άλλων, ως μοριακούς ελέγχους για τις φηβ-συγκεκριμένες ακολουθίες και στην παραγωγή των φηβ-συγκεκριμένων αντιγόνων και των ανοσολογικών αντιδραστηρίων.