Disclosed are new methods comprising the use of in situ hybridization to detect abnormal nucleic acid sequence copy numbers in one or more genomes wherein repetitive sequences that bind to multiple loci in a reference chromosome spread are either substantially removed and/or their hybridization signals suppressed. The invention termed Comparative Genomic Hybridization (CGH) provides for methods of determining the relative number of copies of nucleic acid sequences in one or more subject genomes or portions thereof (for example, a tumor cell) as a function of the location of those sequences in a reference genome (for example, a normal human genome). The intensity(ies) of the signals from each labeled subject nucleic acid and/or the differences in the ratios between different signals from the labeled subject nucleic acid sequences are compared to determine the relative copy numbers of the nucleic acid sequences in the one or more subject genomes as a function of position along the reference chromosome spread. Amplifications, duplications and/or deletions in the subject genome(s) can be detected. Also provided is a method of determining the absolute copy numbers of substantially all RNA or DNA sequences in subject cell(s) or cell population(s).

Показаны новые методы состоя из пользы in situ гибридизации обнаружить анормалные номера экземпляра последовательности нуклеиновой кислоты в one or more геномах при котором repetitive последовательности связывают к множественным локусам в распространении хромосомы справки или существенн извлечутся and/or их подавленные сигналы гибридизации. Термин вымысел сравнительной гибридизацией Genomic (CGH) обеспечивает для методов обусловливать относительня число экземпляров последовательностей нуклеиновой кислоты в one or more subject геномах или частях thereof (например, клетка тумора) как функция расположения тех последовательностей в геноме справки (например, нормальном людском геноме). Intensity(ies) сигналов от каждой обозначенной subject нуклеиновой кислоты and/or разницы в коэффициентах между по-разному сигналами от обозначенных subject последовательностей нуклеиновой кислоты сравнены для того чтобы обусловить относительные номера экземпляра последовательностей нуклеиновой кислоты в one or more subject геномах как функция положения вдоль распространения хромосомы справки. Амплификации, дублирования and/or пропускания в subject genome(s) можно обнаружить. Также обеспечен метод обусловливать совершенно номера экземпляра существенн всех последовательностей RNA или ДНАА в subject population(s) cell(s) или клетки.