A method for separating microorganisms, especially infectious agents, from a mixture by two dimensional centrifugation on the basis of sedimentation rate and isopycnic banding density, for sedimenting such microorganisms through zones of immobilized reagents to which they are resistant, for detecting banded particles by light scatter or fluorescence using nucleic acid specific dyes, and for recovering the banded particles in very small volumes for characterization by mass spectrometry of viral protein subunits and intact viral particles, and by fluorescence flow cytometric determination of both nucleic acid mass and the masses of fragments produced by restriction enzymes. The method is based on the discovery that individual microorganisms, such as bacterial and viral species, are each physically relatively homogeneous, and are distinguishable in their biophysical properties from other biological particles, and from non-biological particles found in nature. The method is useful for distinguishing infections, for identifying known microorganisms, and for discovering and characterizing new microorganisms. The method provides very rapid identification of microorganisms, and hence allows a rational choice of therapy for identified infectious agents. A particularly useful application is in clinical trials of new antibiotics and antivirals, where it is essential to identify at the outset individuals infected with the targeted infectious agent.

Eine Methode für das Trennen der Mikroorganismen, besonders ansteckende Vertreter, von einer Mischung durch zweidimensionale Zentrifugierung auf der Grundlage von Sedimentbildungrate und isopycnic Streifenbildungen Dichte, für das Sedimentieren solcher Mikroorganismen durch Zonen der stillgestellten Reagenzien, gegen die sie beständig sind, denn das Ermitteln der mit einem Band versehenen Partikel durch helle Streuung oder der Fluoreszenz mit Nukleinsäurebesonderefärbungen und für das Zurückgewinnen der mit einem Band versehenen Partikel in den sehr kleinen Volumen für Kennzeichnung durch Massenspektrometrie der Virenproteinuntereinheiten und der intakten Virenpartikel und durch cytometric Ermittlung des Fluoreszenzflusses von beiden Nukleinsäuremasse und die Massen der Fragmente produzierte durch Beschränkung Enzyme. Die Methode basiert auf der Entdeckung, die einzelne Mikroorganismen, wie bakterielle und Virensorte, jeder physikalisch verhältnismäßig homogen sind, und ist in ihren biophysikalischen Eigenschaften von anderen biologischen Partikeln und von den nicht-biologischen Partikeln unterscheidbar, die in der Natur gefunden werden. Die Methode ist für das Unterscheiden von von Infektion, für das Kennzeichnen der bekannten Mikroorganismen und für das Entdecken und das Kennzeichnen der neuen Mikroorganismen nützlich. Die Methode liefert sehr schnelle Kennzeichnung der Mikroorganismen und erlaubt folglich eine rationale Wahl der Therapie für gekennzeichnete ansteckende Mittel. Eine besonders nützliche Anwendung ist in den klinischen Versuchen der neuen Antibiotika und der antivirals, in denen zu kennzeichnen ist wesentlich, am Anfang die Einzelpersonen, die mit dem gerichteten ansteckenden Mittel angesteckt werden.