The invention relates to a method of generating a signal indicative of the presence of a target nucleic acid sequence in a sample, where the method includes forming a cleavage structure by incubating a sample comprising a target nucleic acid sequence with a probe having a secondary structure that changes upon binding of the probe to the target nucleic acid sequence, and cleaving the cleavage structure with a nuclease to release a nucleic acid fragment to generate a signal, wherein generation of the signal is indicative of the presence of a target nucleic acid sequence in a sample. The invention also relates to a method of detecting or measuring a target nucleic acid sequence in a sample, where the method includes forming a cleavage structure by incubating a sample containing a target nucleic acid sequence with a probe having a secondary structure that changes upon binding of the probe to a target nucleic acid sequence and cleaving the cleavage structure with a nuclease to generate a cleaved nucleic acid fragment.

De uitvinding heeft op een methode om een signaal te produceren indicatief van de aanwezigheid van een opeenvolging van het doel nucleic zuur in een steekproef, waar de methode het vormen van een splijtenstructuur door een steekproef uit te broeden bestaand uit een opeenvolging van het doel nucleic zuur met een sonde omvat die een secundaire structuur heeft die op band van de sonde in de opeenvolging van het doel nucleic zuur verandert, en de splijtenstructuur betrekking met een nuclease te splijten om een nucleic zuurfragment vrij te geven om een signaal te produceren, waarin de generatie van het signaal van de aanwezigheid van een opeenvolging van het doel nucleic zuur in een steekproef indicatief is. De uitvinding heeft ook op een methode om een opeenvolging van het doel nucleic zuur in een steekproef betrekking te ontdekken of te meten, waar de methode het vormen van een splijtenstructuur door een steekproef omvat uit te broeden die een opeenvolging van het doel nucleic zuur met een sonde bevat die een secundaire structuur heeft die op band van de sonde in een doel nucleic zuur opeenvolging en het splijten van de splijtenstructuur met een nuclease om een gespleten nucleic zuurfragment te produceren verandert.