A method of making a synthetic nucleic acid sequence comprises providing a
starting nucleic acid sequence, which optionally encodes an amino acid
sequence, and determining the predicted .DELTA.G.sub.folding of the
sequence. The starting nucleic acid sequence can be a naturally occurring
sequence or a non-naturally occurring sequence. The starting nucleic acid
sequence is modified by replacing at least one codon from the starting
nucleic acid sequence with a different corresponding codon to provide a
modified nucleic acid sequence. As used herein, a "different corresponding
codon" refers to a codon which does not have the identical nucleotide
sequence, but which encodes the identical amino acid. The predicted
.DELTA.G.sub.folding of the modified nucleic acid sequence is determined
and compared with the .DELTA.G.sub.folding of the starting nucleic acid
sequence. In accordance with the invention, the predicted
.DELTA.G.sub.folding of the starting nucleic acid sequence can be
determined before or after the modified starting nucleic acid is provided.
Une méthode de la fabrication d'un ordre synthétique d'acide nucléique comporte fournir un ordre commençant d'acide nucléique, qui code sur option un ordre d'acide aminé, et déterminer le DELTA.G.sub.folding prévu de l'ordre. L'ordre commençant d'acide nucléique peut être un ordre naturel ou un ordre non-naturally d'occurrence. L'ordre commençant d'acide nucléique est modifié en remplaçant au moins un codon de l'ordre commençant d'acide nucléique avec un codon correspondant différent pour fournir un ordre modifié d'acide nucléique. Comme utilisé ci-dessus, "un codon correspondant différent" se rapporte à un codon qui n'a pas l'ordre identique de nucléotide, mais qui code l'acide aminé identique. Le DELTA.G.sub.folding prévu de l'ordre modifié d'acide nucléique est déterminé et comparé au DELTA.G.sub.folding de l'ordre commençant d'acide nucléique. Selon l'invention, le DELTA.G.sub.folding prévu de l'ordre commençant d'acide nucléique peut être déterminé avant ou après que l'acide nucléique commençant modifié soit fourni.
