The present invention defines a DNA: protein-binding assay useful for screening libraries of synthetic or biological compounds for their ability to bind DNA test sequences. The assay is versatile in that any number of test sequences can be tested by placing the test sequence adjacent to a defined protein binding screening sequence. Binding of molecules to these test sequence changes the binding characteristics of the protein molecule to its cognate binding sequence. When such a molecule binds the test sequence the equilibrium of the DNA:protein complexes is disturbed, generating changes in the concentration of free DNA probe. Numerous exemplary target test sequences (SEQ ID NO:1 to SEQ ID NO:600) are set forth. The assay of the present invention is also useful to characterize the preferred binding sequences of any selected DNA-binding molecule.

La presente invenzione definisce un DNA: analisi proteina-legantesi utile per le biblioteche della selezione dei residui sintetici o biologici affinchè la loro capacità leghino le sequenze di prova del DNA. L'analisi è versatile in quanto tutto il numero di sequenze di prova può essere esaminato disponendo la sequenza di prova adiacente ad una sequenza obbligatoria definita della selezione della proteina. Legandosi delle molecole ai questi sequenza di prova cambia le caratteristiche obbligatorie della molecola della proteina alla relativa sequenza obbligatoria cognate. Quando una tal molecola lega la sequenza di prova l'equilibrio dei complessi di DNA:protein è disturbato, generante cambia nella concentrazione della sonda libera del DNA. Le sequenze di prova esemplari numerose dell'obiettivo (identificazione SEQ NO:1 all'identificazione SEQ NO:600) sono disposte. L'analisi di presente invenzione è inoltre utile da caratterizzare le sequenze obbligatorie preferite di tutta la molecola DNA-LEGANTESI selezionata.