For evaluation of a target DNA sequence, a sample mixture is prepared containing one or more sets of sequencing polynucleotide fragments, each set containing fragments having lengths indicative of the positions of at least one base within the target DNA sequence. These sequencing fragment sets are each labeled with a different type of label (for example fluorescent labels). The sample mixture also includes a set of calibrant polynucleotide fragments having a plurality of known fragment lengths. The calibrant polynucleotide fragments are labeled with a spectroscopically-distinguishable calibrant label. The sample mixture is then electrophoretically separated to separate the polynucleotide fragments as a function of fragment length. Real-time detection is used to detect the label(s) on the set(s) of sequencing fragments and the calibrant label as they migrate in a common lane of the separation medium to produce a sequencing data trace and a calibrant data trace. The calibrant peaks are then used to define a set of coefficients for linearizing the sequencing data trace from each lane to a common corrected time scale in which the peaks from each lane are evenly spaced. The linearized sequencing data traces are then aligned by assigning base position numbers to each peak in the sequencing data traces, and these aligned traces are used for base calling.

Per la valutazione di una sequenza del DNA dell'obiettivo, una miscela del campione è preparata che contiene uno o più insiemi di ordinare i frammenti in serie di polynucleotide, ogni insieme che contiene i frammenti che hanno lunghezze indicative delle posizioni almeno di una base all'interno della sequenza del DNA dell'obiettivo. Questi che ordinano gli insiemi in serie ciascuno del frammento sono identificati con un tipo di etichetta differente (per esempio etichette fluorescenti). La miscela del campione inoltre include un insieme dei frammenti calibrant di polynucleotide che hanno una pluralità di lunghezze conosciute del frammento. I frammenti calibrant di polynucleotide sono identificati con un'etichetta calibrant spettroscopico-distinguibile. La miscela del campione allora è separata elettroforeticamente per separare i frammenti di polynucleotide in funzione della lunghezza del frammento. La rilevazione in tempo reale è usata per rilevare il label(s) sul set(s) di ordinare i frammenti e l'etichetta in serie calibrant mentre migrano in un vicolo comune del mezzo di separazione a prodotti una traccia ordinante di dati ed i dati calibrant seguono. I picchi calibrant allora sono usati per definire un insieme dei coefficenti per la linearizzazione della traccia ordinante di dati da ogni vicolo ad una scaletta temporale corretta comune in cui i picchi da ogni vicolo sono spaziati uniformemente. Le tracce ordinanti linearizzate di dati allora sono state allineate assegnando i numeri di posizione bassi ad ogni picco nelle tracce ordinanti di dati e queste tracce state allineate sono usate per la chiamata bassa.