Disclosed is a method for the comprehensive analysis of nucleic acid samples and a detector composition for use in the method. The method involves amplifying nucleic acid fragments of interest using a primer that can form a hairpin structure; sequence-based coupling of the amplified fragments to detector probes; and detection of the coupled fragments. The amplified fragments are coupled by hybridization and coupling, preferably by ligation, to detector probes. A hairpin structure formed at the end of the amplified fragments facilitates coupling of the fragments to the probes. The method allows detection of the fragments where detection provides some sequence information for the fragments. The method allows a complex sample of nucleic acid to be quickly and easily cataloged in a reproducible and sequence-specific manner. The method can also be used to detect amplified fragments having a known sequence.

Révélée est une méthode pour l'analyse complète des échantillons d'acide nucléique et une composition en détecteur pour l'usage dans la méthode. La méthode implique d'amplifier des fragments d'acide nucléique d'intérêt à l'aide d'une amorce qui peut former une structure d'épingle à cheveux ; l'accouplement ordre-basé des fragments amplifiés au détecteur sonde ; et détection des fragments couplés. Les fragments amplifiés sont couplés par l'hybridation et l'accouplement, de préférence par ligature, au détecteur sonde. Une structure d'épingle à cheveux a formé à l'extrémité des fragments amplifiés facilite l'accouplement des fragments aux sondes. La méthode permet la détection des fragments où la détection fournit quelques informations d'ordre pour les fragments. La méthode permet à un échantillon complexe d'acide nucléique cataloguer rapidement et facilement d'une façon reproductible et ordre-spécifique. La méthode peut également être employée pour détecter les fragments amplifiés avoir un ordre connu.