A method of analyzing DNA fragments separated electrophoretically is presented. The method includes the use of an expert system that interprets raw or preprocessed signal from the separation. The expert system can be used for real-time base-calling, or applied offline after data acquisition is complete. The expert system is directly applicable to all types of electrophoretic separation used for DNA sequencing, i.e. slab gel, capillary and microchip. Each lane of a multiplex system can consist of 1 to 4 (or even more) different fragment labels. The expert system may also be used with other base-coding schemes, such as those in which more than one base is labeled with a given dye, but the amount of label is different for each base. When the presently disclosed method is applied to DNA sequencing, the resulting interpretation comprises a DNA base sequence with numerical confidences assigned to each base. By use of the presently disclosed method the degree of automation of data processing in high-throughput DNA sequencing is improved, as is the quality of the results.

Eine Methode des Analysierens der DNA Fragmente, die elektrophoretisch getrennt werden, wird dargestellt. Die Methode schließt den Gebrauch von einem Expertensystem ein, das rohes oder vorbearbeitetes Signal von der Trennung deutet. Das Expertensystem kann für das Unterseite-Realzeitbenennen benutzt werden, oder zugetroffen worden indirekt nach Datenerfassung ist komplett. Das Expertensystem ist direkt auf alle Arten elektrophoretische Trennung benutzt für der Reihe nach ordnende DNA, d.h. Plattegel, Kapillare und Mikrochip anwendbar. Jeder Weg eines Multiplexsystems kann aus 1 bis 4 (oder sogar mehr) unterschiedlichen Fragmentaufklebern bestehen. Das Expertensystem kann mit anderen Unterseite-Kodierung Entwürfen, wie denen auch benutzt werden, in denen mehr als eine Unterseite mit einer gegebenen Färbung beschriftet wird, aber die Menge des Aufklebers für jede Unterseite unterschiedlich ist. Wenn die momentan freigegebene Methode an der Reihe nach ordnender DNA angewendet wird, enthält die resultierende Deutung eine DNA niedrige Reihenfolge mit den numerischen confidences, die jeder Unterseite zugewiesen werden. Mittels die momentan freigegebene Methode wird der Grad von Automatisierung der Datenverarbeitung, beim Hochdurchsatz DNA Der Reihe nach ordnen verbessert, wie die Qualität der Resultate.