Methods are provided for the analysis and determination of the nature of single nucleic acid polymorphisms (SNPs) in a genetic target. In one method of this invention, the nature of the SNPs in the genetic target is determined by the steps of providing a plurality of hybridization complexes arrayed on a plurality of test sites on an electronically bioactive microchip, where the hybridization complex includes at least a nucleic acid target containing a SNP, a stabilizer probe having a sequence complementary to the target sequence and/or reporter probe, and a reporter probe having a selected sequence complementary to either the stabilizer or the same target sequence strand wherein a selected sequence of the reporter includes either a wild type nucleotide or a nucleotide corresponding to the SNP of the target. In accordance with the invention, the stabilizer, reporter and target amplicons are hybridized using electronic assistance of the microchip system such that base-stacking energies are utilized in discerning among other identifying indicators, the presence of wild type or polymorphism sequence. Applications include disease diagnostics, such as for the identification of polymorphisms in structural genes, regulatory regions, antibiotic or chemotherapeutic resistance conferring regions, or for SNPs associated with speciation or used for determination of genetic linkage.

Methoden werden für die Analyse und die Ermittlung der Natur der einzelnen Nukleinsäurepolymorphien (SNPs) in einem genetischen Ziel zur Verfügung gestellt. In einer Methode dieser Erfindung, wird die Natur des SNPs im genetischen Ziel durch die Schritte des Zur Verfügung stellens einer Mehrzahl der Hybridationkomplexe festgestellt, die auf einer Mehrzahl der Testaufstellungsorte auf einem elektronisch bioactive Mikrochip gekleidet werden, in denen der Hybridationkomplex mindestens ein Nukleinsäureziel einschließt, das ein SNP, eine Ausgleicherprüfspitze enthält, die eine Reihenfolge hat, die zur Zielreihenfolge und/oder -reporterprüfspitze ergänzend ist, und einer Reporterprüfspitze, die eine vorgewählte Reihenfolge hat, die entweder zum Ausgleicher oder zur gleichen Zielreihenfolge Faser, worin eine vorgewählte Reihenfolge des Reporters, ergänzend ist entweder eine wilde Art Nukleotid oder ein Nukleotid, das dem SNP des Ziels entspricht miteinschließt. In Übereinstimmung mit der Erfindung werden die Ausgleicher, Reporter und Ziel amplicons mit elektronischer Unterstützung des Mikrochipsystems so hybridisiert, daß, Energie Unterseite-stapelnd, im Erkennen unter anderen kennzeichnenden Anzeigen, im Vorhandensein der wilden Art oder in der Polymorphiereihenfolge verwendet werden. Anwendungen schließen Krankheitdiagnose, wie für die Kennzeichnung von Polymorphien in den strukturellen Genen, in den regelnden Region-, antibiotischer oder chemotherapeutischerwiderstand konferierenden Regionen oder für SNPs ein, das mit speciation verbunden oder für Ermittlung des genetischen Gestänges verwendet ist.