The invention encompasses improved polyamides for binding to specific
nucleotide sequences in the minor groove of double stranded DNA. The
3-hydroxy-N-methylpyrrole/N-methylpyrrole carboxamide pair specifically
recognizes the T.multidot.A base pair, while the
N-methylpyrrole/3-hydroxy-N-methylpyrrole pair recognizes A.multidot.T
nucleotide pairs. Similarly, an N-methylimidizole/N-methylpyrrole
carboxamide pair specifically recognizes the G.multidot.C nucleotide pair,
and the N-methylpyrrole/N-methylimidizole carboxamide pair recognizes the
C.multidot.G nucleotide pair.
Η εφεύρεση καλύπτει τα βελτιωμένα πολυαμίδια για τη δέσμευση στις συγκεκριμένες ακολουθίες νουκλεοτίδας στο δευτερεύον αυλάκι του διπλού προσαραγμένου DNA. Το carboxamide 3-υδροξύ-ν/ν -ν-μετχυλπυρρολε ζευγάρι αναγνωρίζει συγκεκριμένα το ζευγάρι βάσεων T.multidot.A, ενώ το ζευγάρι ν-μετχυλπυρρολε/3-υδροξύ-ν αναγνωρίζει τα ζευγάρια νουκλεοτίδας A.multidot.T. Ομοίως, ένα carboxamide ν -ν-μετχυλημηδηζολε/ν -ν-μετχυλπυρρολε ζευγάρι αναγνωρίζει συγκεκριμένα το ζευγάρι νουκλεοτίδας G.multidot.C, και το carboxamide ν -ν-μετχυλπυρρολε/ν -ν-μετχυλημηδηζολε ζευγάρι αναγνωρίζει το ζευγάρι νουκλεοτίδας C.multidot.G.