The present invention relates to a highly accurate and reproducible mathematically-based methodology for quantifying the levels of differential gene expression from microassay protocols. Specifically, the present invention provides a simple deductive approach, grounded in a Bayesian framework, to circumvent the heuristic-based limitation of previous methodologies. Rather than seeking a point-estimate of the fold-change of the level of gene expression, the present invention utilizes the derivation of mathematical formula to determine the a posteriori distribution of all the fold-changes of differential gene expression which may be inferred from the given measurements. From this a posteriori distribution the following information may be obtained: (i) an estimator for the fold-change of the level of gene expression; (ii) confidence limits for the fold-change, at any given confidence level; and (iii) a P-value for assessing the statistical significance of change. The present invention also possesses the advantage that fold-change estimates and confidence limits may even be assigned to signal pairs where both signals are zero or negative, without resorting to heuristic thresholds.

La présente invention concerne une méthodologie mathématique-basée fortement précise et reproductible pour mesurer les niveaux de l'expression différentielle de gène des protocoles de microanalyse. Spécifiquement, la présente invention fournit une approche déductive simple, fondée dans un cadre bayésien, pour éviter la limitation heuristique-basée des méthodologies précédentes. Plutôt que de chercher point-estiment du plier-changent du niveau de l'expression de gène, la présente invention utilise la dérivation de la formule mathématique pour déterminer a posteriori la distribution de tout le plier-change de l'expression différentielle de gène qui peut être impliquée des mesures données. À partir de cette a posteriori distribution l'information suivante peut être obtenue : (i) un estimateur pour plier-changent du niveau de l'expression de gène ; (ii) les limites de fiabilité pour plier-changent, à n'importe quel niveau donné de confiance ; et (iii) une P-valeur pour évaluer la signification statistique du changement. La présente invention possède également l'avantage qui plier-changent des évaluations et des limites de fiabilité peut même être assignée aux paires de signal où les deux signaux sont zéro ou négatifs, sans recourir aux seuils heuristiques.