Computer programs and computer-implemented methods are disclosed for
extracting, analyzing and comparing data from biomolecular binding
experiments. The invention receives a set of values corresponding to the
interaction of one or more target samples with probes on one or more
arrays of biomolecular probes, and uses the values to generate one or more
probability values indicating the probability that a molecular species
complementary to the probe set is not present in the target samples, or is
present at levels greater than or less than one or more reference levels.
The probability values are generated by comparing the values for
individual probes in a probe set with values for a calibration set, which
may include a null set, spiked probe sets, or housekeeping probe sets.
Normalized experimental values are generated for sets of probes on the
arrays using statistical methods. Data is output in the form of data files
including normalized experimental values and probability values for probe
sets in the arrays.
Os programas de computador e os métodos computador-executados são divulgados para extrair, analisar e comparar dados das experiências obrigatórias biomolecular. A invenção recebe um jogo dos valores que correspondem à interação de um ou mais amostra do alvo com as pontas de prova em uma ou em mais disposições de pontas de prova biomolecular, e usa os valores gerar um ou mais probabilidade avalia indicar a probabilidade que uma espécie molecular complementar ao jogo da ponta de prova não está atual nas amostras do alvo, ou está atual nos níveis mais grandes do que ou menos de um ou mais níveis de referência. Os valores da probabilidade são gerados comparando os valores para pontas de prova individuais em um jogo da ponta de prova com os valores para um jogo da calibração, que possa incluir um jogo nulo, uns jogos spiked da ponta de prova, ou uns jogos da ponta de prova das tarefas domésticas. Os valores experimentais normalizados são gerados para jogos das pontas de prova nas disposições usando métodos estatísticos. Os dados output no formulário de arquivos de dados de including valores experimentais normalizados e os valores da probabilidade para a ponta de prova ajustam-se nas disposições.