Methods for determining the presence of double stranded nucleic acids in a sample are provided. In the subject methods, nucleic acids present in a fluid sample are translocated through a nanopore, e.g. by application of an electric field to the fluid sample. The current amplitude through the nanopore is monitored during the translocation process and changes in the amplitude are related to the passage of single- or double-stranded molecules through the nanopore. The subject methods find use in a variety of applications in which the detection of the presence of double-stranded nucleic acids in a sample is desired, e.g. in hybridization assays, such as Northern blot assays, Southern blot assays, array based hybridization assays, etc.

I metodi per la determinazione della presenza di doppi acidi nucleici incagliati in un campione sono forniti. Nei metodi tematici, gli acidi nucleici presenti in un campione fluido sono spostati attraverso un nanopore, per esempio dall'applicazione di un campo elettrico al campione fluido. L'ampiezza corrente attraverso il nanopore è controllata durante il processo di spostamento ed i cambiamenti nell'ampiezza sono collegati con il passaggio di singole o molecole double-stranded attraverso il nanopore. I metodi tematici trovano l'uso in una varietà di applicazioni in cui la rilevazione della presenza degli acidi nucleici double-stranded in un campione è voluta, per esempio nelle analisi di ibridazione, quali le analisi nordiche della macchia, le analisi del sud della macchia, le analisi di ibridazione, ecc basati allineamento.