A digital image processing-based system and method are disclosed for quantitatively assessing nucleic acid species expressed in a microarray. The microarray is a grid of a plurality of sub-grids of the nucleic acid species. The system includes a scanner that has a digital scanning sensor that-scans the microarray and transmits from an output a digital image of the microarray, and a computer that receives the digital image of the microarray from the scanner and then processes the digital image, detecting an expression signal of the nucleic acid species, segmenting the expression signal, calculating a measure of the segmented expression signal, and providing the measure at the output of the computer. Prior to segmenting the expression signal for a nucleic acid species, the expression signal is characterized by a center pixel in the digital image and an approximate radius around the center pixel. The computer segments the expression signal by (a) tentatively classifying pixels within the approximate radius as signal pixels and those outside the approximate radius as background pixels, (b) determining major intensity modes for the signal pixels and for the background pixels, and (c) using the major intensity modes, reclassifying the signal and background pixels depending on each pixel's intensity relative to the major intensity modes.

Un sistema procesar-basado y un método de la imagen digital se divulgan para cuantitativo determinar la especie del ácido nucleic expresada en un microarray. El microarray es una rejilla de una pluralidad de secundario-rejillas de la especie del ácido nucleic. El sistema incluye un explorador que tenga un sensor de exploración digital que-explore el microarray y transmite de una salida una imagen digital del microarray, y de una computadora que reciba la imagen digital del microarray del explorador y después procese la imagen digital, detectando una señal de la expresión de la especie del ácido nucleic, dividiendo la señal de la expresión en segmentos, calculando una medida de la señal dividida en segmentos de la expresión, y proporcionando la medida en la salida de la computadora. Antes de dividir la señal de la expresión en segmentos para una especie del ácido nucleic, la señal de la expresión es caracterizada por un pixel de centro en la imagen digital y un radio aproximado alrededor del pixel de centro. La computadora divide la señal de la expresión en segmentos (a) tentativo clasificando los pixeles dentro del radio aproximado como los pixeles y ésos de la señal fuera del radio aproximado como pixeles del fondo, (b) determinando los modos importantes de la intensidad para los pixeles de la señal y para los pixeles del fondo, y (c) con los modos principales de la intensidad, reclasificando los pixeles de la señal y del fondo dependiendo de la intensidad de cada pixel concerniente a los modos principales de la intensidad.