The present invention provides methods and apparatus for performing biological reactions on a substrate surface that use a low volume of sample fluid, accommodate substrates as large as or larger than a conventional microscope slide, accommodate a plurality of independent reactions, and accommodate a substrate surface having one or more hydrogel-based microarrays attached thereto. The invention further provides an apparatus that allows introduction of fluids in addition to sample fluid into each reaction chamber via standard pipet tips and associated pipettor apparatus. The invention further an apparatus that increases reaction reproducibility, increases reaction efficiency, and reduces reaction duration. The preferred embodiment of the invention is configured to accommodate a standard microscope slide substrate having four hydrogel-based microarrays attached thereto and comprises a base plate having a well structure corresponding to each microarray and two fluid ports extending through the base plate into each well structure, a means for temporarily clamping the substrate against the base plate such that the microarrays face into the well structures, a means for sealing the perimeter around each microarray and well structure, and a means for sealing the fluid ports from the environment.

La actual invención proporciona métodos y el aparato para realizar las reacciones biológicas en una superficie del substrato que utilizan un bajo volumen de líquido de la muestra, acomodan los substratos tan grandes como o más grande que una diapositiva convencional del microscopio, acomoda una pluralidad de reacciones independientes, y acomoda una superficie del substrato que tiene uno o más los microarrays hydrogel-basados unidos además. La invención más futura proporciona un aparato que permita la introducción de líquidos además del líquido de la muestra en cada compartimiento de la reacción vía estándar mida con una pipeta extremidades y el aparato asociado del pipettor. La invención fomenta un aparato que aumente reproductibilidad de la reacción, aumente eficacia de la reacción, y reduzca la duración de la reacción. La encarnación preferida de la invención se configura para acomodar un substrato estándar de la diapositiva del microscopio que hace cuatro microarrays hydrogel-basados unir además y abarca un embase que tiene una estructura bien el corresponder a cada puertos microarray y dos flúidos que extienden a través del embase en cada uno la estructura del pozo, los medios para temporalmente afianzar el substrato con abrazadera contra el embase tales que la cara de los microarrays en las estructuras del pozo, los medios para sellar el perímetro alrededor de cada estructura microarray y bien, y los medios para sellar los puertos del líquido del ambiente.