Systems and methods are described that may be applied to scanning biological materials in or on probe arrays. For example, a system is described that includes a scanner that has one or more excitation sources and an emission receiving element, such as an objective lens, that receives from locations of the probe array an emission signal responsive to the excitation sources. The scanner also has a radial position generator that generates radial positions of the emission receiving element. Also included in the system is a computer memory having stored therein a plurality of position data, each representing a radial position of the emission receiving element. Also stored in the computer memory unit is a set of comparator instructions that generate a clock signal based, at least in part, on comparing one or more of the plurality of radial positions with one or more of the plurality of position data.

De systemen en de methodes worden beschreven die op het aftasten van biologische materialen in of op sondeseries kunnen worden toegepast. Bijvoorbeeld, wordt een systeem beschreven dat een scanner omvat die één of meerdere opwindingsbronnen en een emissie heeft die element, zoals een objectieve lens ontvangt, die van plaatsen van de sondeserie een emissiesignaal ontvankelijk voor de opwindingsbronnen ontvangt. De scanner heeft ook een radiale positiegenerator die radiale posities van de emissie produceert die element ontvangt. Ook omvat in het systeem wordt een computergeheugen daarin hebben opgeslagend een meerderheid van positiegegevens, elk die een radiale positie van de emissie vertegenwoordigt die element ontvangt. Ook opgeslagen in computer is de geheugeneenheid een reeks comparateursinstructies die een kloksignaal produceren dat, op zijn minst voor een deel, bij het vergelijken van één of meer van de meerderheid van radiale posities met één of meer van de meerderheid van positiegegevens wordt gebaseerd.