The present invention relates to a method of selecting a protein variant
having reduced immunogenicity as compared with the parent protein. This
method includes the steps of screening a random peptide display package
library with antibodies raised against any protein of interest, sequencing
the amino acid sequence of the antibody binding peptides, or the DNA
sequence encoding the antibody binding peptides, identifying epitope
patterns of a protein by sequence alignment of the reactive peptide
sequence, localization of epitope patterns on the primary 3-dimensional
structure of the parent protein, defining an epitope area including amino
acids situated within 5 .ANG. from the epitope amino acids, and affecting
antibody binding to the epitope, changing the localized epitope patterns,
or amino acids defining the epitope area of the parent protein by genetic
engineering mutations of a DNA sequence encoding the parent protein
without impairing functionality of the protein using the emerging epitode
database for eliminating amino acid substitutions creating new or
duplicating existing epitope patterns, introducing the mutated DNA
sequence into a suitable host, culturing the host and expressing the
protein variant, and evaluating the immunogenicity of the protein variant
using the parent protein as reference. The invention further relates to
the protein variant and its use, as well as to a method for producing said
protein variant.
La présente invention concerne une méthode de choisir une variante de protéine ayant réduit l'immunogénicité par rapport à la protéine de parent. Cette méthode inclut les étapes de protéger une bibliothèque aléatoire de paquet d'affichage de peptide avec des anticorps augmentés contre n'importe quelle protéine d'intérêt, ordonnançant l'ordre d'acide aminé des peptides obligatoires d'anticorps, ou l'ordre d'ADN codant les peptides obligatoires d'anticorps, identifiant des modèles d'epitope d'une protéine par l'alignement d'ordre de l'ordre réactif de peptide, localisation des modèles d'epitope sur la structure à trois dimensions primaire de la protéine de parent, définissant un secteur d'epitope comprenant des acides aminés situé à moins de l'ANG. 5 des acides aminés d'epitope, et affectant l'anticorps liant à l'epitope, changeant les modèles localisés d'epitope, ou des acides aminés définissant le secteur d'epitope de la protéine de parent par des mutations de génétique d' Ordre d'ADN codant la protéine de parent sans altérer la fonctionnalité de la protéine en utilisant la base de données naissante d'epitode pour éliminer des substitutions d'acide aminé créant de nouveaux ou reproduisants modèles existants d'epitope, présentant l'ordre subi une mutation d'ADN dans un centre serveur approprié, cultivant le centre serveur et exprimant la variante de protéine, et évaluant l'immunogénicité de la variante de protéine en utilisant la protéine de parent comme référence. L'invention autre se relie à la variante de protéine et à son utilisation, aussi bien qu'à une méthode pour produire ladite variante de protéine.