Method and apparatus for high-performance sequence comparison

   
   

A computer-implemented method and apparatus for performing remote sequence comparison. Multiple query sequences are searched against one or more sequence databases. The method includes partitioning the query sequences and partitioning the sequence databases into smaller subsets, assigning searching tasks to members of a group of computers working in parallel, each member further dividing a task into related tasks on a virtual memory shared memory bulletin board for providing high-performance and high-speed sequence comparison.

Un metodo e un apparecchio calcolatore-effettuati per realizzare confronto a distanza di sequenza. Le sequenze multiple di domanda sono cercate contro una o più basi di dati di sequenza. Il metodo include dividere le sequenze di domanda e dividere le basi di dati di sequenza nei più piccoli sottoinsiemi, assegnanti cercando le mansioni ai membri di un gruppo dei calcolatori che funzionano parallelamente, ogni membro più ulteriormente che divide un'operazione nelle mansioni relative su un bordo comune del bollettino di memoria di memoria virtuale per fornire il confronto ad alto rendimento ed ad alta velocità di sequenza.

 
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