The present invention describes methods and devices for sequencing a
polynucleotide by determining subsets of composite subsequences present in
nucleic acid subsamples generated from the sample polynucleotide. A
hairpin primer interrogates the composite subsequences in a two-step
process resulting first in a polymerase extended product whose synthesis
identifies the first subsequence of the composite subsequence. The second
subsequences are identified by hybridizing the polymerase extended
products or amplified products therefrom to an array of capture probes
wherein each capture probe is positionally distinguishable from other
capture probes. The invention is applicable to the quantitative
determination of the presence of nucleic acids in a sample, for
identifying differences in the relative abundance of nucleic acids in a
mixture of nucleic acids, and generally, to diagnostic aids for the
identification of nucleic acids.
Die anwesende Erfindung beschreibt Methoden und Vorrichtungen für das Der Reihe nach ordnen eines polynucleotide, indem sie Teilmengen der zusammengesetzten subsequences feststellt, die in den Nukleinsäureteilproben vorhanden sind, die vom Beispielpolynucleotide erzeugt werden. Eine Haarnadelzündkapsel fragt die zusammengesetzten subsequences in einem zweistufigen Prozeß ab, resultierend zuerst in einem Polymerase verlängerten Produkt dessen Synthese das erste subsequence des zusammengesetzten subsequence kennzeichnet. Die zweiten subsequences werden gekennzeichnet, indem man die Polymerase verlängerten Produkte hybridisiert, oder verstärkte Produkte daher zu einer Reihe der Sicherung prüft, worin jede Sicherung Prüfspitze von anderen Sicherung Prüfspitzen positionally unterscheidbar ist. Die Erfindung ist auf die quantitative Ermittlung des Vorhandenseins der Nukleinsäuren in einer Probe, für das Kennzeichnen von von Unterschieden bezüglich des relativen Überflußes an den Nukleinsäuren in einer Mischung der Nukleinsäuren und im Allgemeinen, auf Diagnosehilfsmittel für die Kennzeichnung der Nukleinsäuren anwendbar.
