The present invention provides a method for the analysis of linkage
disequilibrium between at least one marker locus and a disease or trait
locus of interest. The method comprises the steps of: (a) providing a data
set comprising a marker locus with at least two alleles for a plurality of
extended pedigrees (e.g., plant pedigrees, animal pedigrees), where N is
the number of unrelated extended pedigrees, at least one of said extended
pedigrees containing at least one informative nuclear family or
informative discordant sibship; then (b) determining a random variable
X.sub.T for each triad within an informative nuclear family for each
allele M.sub.i ; (c) determining a random variable X.sub.S for each DSP
within an informative discordant sibship for each allele M.sub.i ; (d)
determining a summary random variable D from X.sub.S and X.sub.T for each
of said extended pedigrees for each allele M.sub.i ; and then (e)
determining a statistic T from each of said summary random variables D
from each of said N unrelated extended pedigrees for each allele M.sub.i.
An extreme (large or small) value for T indicates greater linkage
disequilibrium.
A invenção atual fornece um método para a análise do disequilibrium do enlace entre ao menos um locus do marcador e um locus da doença ou do traço do interesse. O método compreende as etapas de: (a) fornecendo uma série de dados de que compreende um locus do marcador com ao menos os dois alleles para um plurality de pedigrees prolongados (por exemplo, pedigrees da planta, pedigrees animais), onde N é o número de pedigrees prolongados unrelated, ao menos um dos pedigrees prolongados ditos que contêm ao menos uma família nuclear informative ou o sibship discordant informative; então (b) determinando uma variável aleatória X.sub.T para cada tríade dentro de uma família nuclear informative para cada allele M.sub.i; (c) determinando uma variável aleatória X.sub.S para cada DSP dentro de um sibship discordant informative para cada allele M.sub.i; (d) determinando uma variável aleatória sumária D de X.sub.S e de X.sub.T para cada um de pedigrees prolongados ditos para cada allele M.sub.i; e então (e) determinando um statistic T de cada uma das variáveis aleatórias sumárias ditas D de cada um de pedigrees prolongados unrelated ditos de N para cada allele M.sub.i. Um valor (grande ou pequeno) extremo para T indica um disequilibrium mais grande do enlace.
