Methods of identifying ligand binding sites in a target molecule such as a
polynucleotide or polypeptide, as well as methods for determining whether
a particular site in a target molecule is at or near the ligand binding
site, are provided. Ligand binding affinities corresponding to both the
target molecule and a modified version thereof are compared, preferably
using mass spectral analysis. The modified molecules, or test molecules,
incorporate a modification capable of modulating ligand binding affinity
when located at or near the ligand binding sites. Binding site information
is derived from the known position of the modification.
De methodes om ligand bandplaatsen in een doelmolecule zoals een polynucleotide of een polypeptide te identificeren, evenals de methodes om te bepalen of een bepaalde plaats in een doelmolecule bij of dichtbij de plaats is van de ligandband worden, verstrekt. Worden de bindende affiniteiten die van Ligand aan zowel de doelmolecule als een gewijzigde versie beantwoorden daarvan vergeleken, bij voorkeur gebruikend massa spectrale analyse. De gewijzigde molecules, of de testmolecules, nemen een wijziging geschikt om ligand bindende affiniteit op te moduleren wanneer gevestigd bij of dichtbij de plaatsen van de ligandband. De de plaatsinformatie wordt van de band afgeleid uit de bekende positie van de wijziging.
