End sequence profiling

   
   

The present invention provides a novel method to identify rearrangements in a test genome, e.g., a tumor genome, when compared to a reference genome. This method provides major improvements over previous methods in terms of efficiency, rapidity, and cost-effectiveness. Briefly, this method involves generating or obtaining a large insert vector library from a test genome, sequencing the ends of the inserts in the library, and comparing the co-linearity of the sequenced ends in the library with corresponding sequences within a substantially-sequenced reference genome. This invention is useful for any of a number of applications, including for identifying rearrangements in tumor genomes and for determining genetic differences between closely related species as well as between different strains of the same species.

Присытствыющий вымысел обеспечивает метод романа для того чтобы определить перераспределения в геноме испытания, например, геноме тумора, после того как он сравниван к геному справки. Этот метод обеспечивает главные улучшения над ранее методами in terms of эффективность, внезапность, и затратыэффективность. Кратко, этот метод включает произвести или получить большой архив вектора вставки от генома испытания, sequencing концы вставок в архив, и сравнивая чо-linearnosti sequenced концов в архиве с соответствуя последовательностями в пределах существенн-substantially-sequenced генома справки. Этот вымысел полезн для любого из нескольких применений, вклюающ для определять перераспределения в геномы тумора и для обусловливать генетические разницы между близко отнесенными видами также,как между по-разному напряжения такого же вида.

 
Web www.patentalert.com

< Choline monooxygenase gene

< Inbred maize line PH6JM

> Hybrid maize plant and seed 36N70

> Rapid cell block embedding method and apparatus

~ 00128