The present invention provides a novel method to identify rearrangements in
a test genome, e.g., a tumor genome, when compared to a reference genome.
This method provides major improvements over previous methods in terms of
efficiency, rapidity, and cost-effectiveness. Briefly, this method
involves generating or obtaining a large insert vector library from a test
genome, sequencing the ends of the inserts in the library, and comparing
the co-linearity of the sequenced ends in the library with corresponding
sequences within a substantially-sequenced reference genome. This
invention is useful for any of a number of applications, including for
identifying rearrangements in tumor genomes and for determining genetic
differences between closely related species as well as between different
strains of the same species.
Присытствыющий вымысел обеспечивает метод романа для того чтобы определить перераспределения в геноме испытания, например, геноме тумора, после того как он сравниван к геному справки. Этот метод обеспечивает главные улучшения над ранее методами in terms of эффективность, внезапность, и затратыэффективность. Кратко, этот метод включает произвести или получить большой архив вектора вставки от генома испытания, sequencing концы вставок в архив, и сравнивая чо-linearnosti sequenced концов в архиве с соответствуя последовательностями в пределах существенн-substantially-sequenced генома справки. Этот вымысел полезн для любого из нескольких применений, вклюающ для определять перераспределения в геномы тумора и для обусловливать генетические разницы между близко отнесенными видами также,как между по-разному напряжения такого же вида.
