In a sequence homology detection aspect of the invention, a computer-based
method of detecting homologies between a plurality of sequences in a
database and a query sequence comprises the following steps. First, the
method includes accessing patterns associated with the database, each
pattern representing at least a portion of one or more sequences in the
database. Next, the query sequence is compared to the patterns to detect
whether one or more portions of the query sequence are homologous to
portions of the sequences of the database represented by the patterns.
Then, a score is generated for each sequence detected to be homologous to
the query sequence, wherein the sequence score is based on individual
scores generated in accordance with each homologous portion of the
sequence detected, and the sequence score represents a degree of homology
between the query sequence and the detected sequence.
В аспекте обнаружения гомологичности последовательности вымысла, computer-based метод обнаруживать гомологичности между множественностью последовательностей в базе данных и последовательностью query состоит из following шагов. Во первых, метод вклюает достигая картины связанные с базой данных, каждой картиной представляя по крайней мере часть one or more последовательностей в базе данных. Затем, последовательность query сравнена к картинам для того чтобы обнаружить ли one or more части последовательности query гомологичны к частям последовательностей базы данных представленной картинами. После этого, счет произведен для каждой последовательности обнаруженные, что был гомологичн к последовательности query, при котором счет последовательности основан на индивидуальных счетах произведенных в соответствии с каждой гомологичной частью обнаруженной последовательности, и счет последовательности представляет степень гомологичности между последовательностью query и обнаруженной последовательностью.
