Compositions and methods for detecting raphidophytes

   
   

Effective management of finfish stocks to avoid or mitigate the threat of fish-killing phytoplankton is of increasing concern, particularly in temperate seas. Intensive spatial and temporal sampling is required to monitor and quantify potentially harmful species, so that prior warning can be received of an imminent bloom. The use of large-subunit rRNA (LSU rRNA)-targeted oligonucleotide probes based on the sandwich hybridization assay to detect the fragile species Heterosigma akashiwo (Hada) Hada and Fibrocapsa japonica Toriumi & Takano (Raphidophyceae) is disclosed. Species-specific sandwich hybridization assays were successfully developed for various Raphidophytes.

La gestion efficace des stocks de finfish pour éviter ou atténuer la menace du phytoplancton de poisson-massacre est de préoccupation croissante, en particulier dans les mers tempérées. Le prélèvement spatial et temporel intensif est exigé pour surveiller et mesurer des espèces potentiellement nocives, de sorte que l'avertissement préalable puisse être reçu d'une fleur imminente. L'utilisation du rRNA de grand-sous-unité (LSU rRNA)-a visé des sondes d'oligonucléotide basées sur l'analyse d'hybridation de sandwich pour détecter l'akashiwo fragile de Heterosigma d'espèces (Hada) Hada et japonica Toriumi de Fibrocapsa et Takano (Raphidophyceae) est révélé. Des analyses d'hybridation de sandwich à espèce-specific ont été avec succès développées pour divers Raphidophytes.

 
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