The present invention relates to a method for the rapid and reliable
detection of drug-selected mutations in the HIV protease gene allowing the
simultaneous charaterization of a range of codons involved in drug
resistance using specific sets of probes optimized to function together in
a reverse-hybridization assay. More particularly, the present invention
relates to a method for determining the susceptibility to antiviral drugs
of HIV viruses in a biological sample, with said method comprising: a) if
need be, releasing, isolating or concentrating the polynucleic acids
present in the sample; b) if need be amplifying the relevant part of the
protease gene of HIV with at least one suitable primer pair; c)
hybrydizing the polynucleic acids of step a) or b) with at least one of
the following probes: probes specifically hybridizing to a target sequence
comprising codon 30; probes specifically hybridizing to a target sequence
comprising codon 46 and/or 48; probes specifically hybridizing to a target
sequence comprising codon 50; probes specifically hybridizing to a target
sequence comprising codon 54; probes specifically hybridizing to a target
sequence comprising codon 82 and/or 84; probes specifically hybridizing to
a target sequence comprising codon 90; or the complement of said probes;
further characterized in that said probes specifically hybridize to any of
the target sequences presented in FIG. (1), or the complement of said
target sequences; d) inferring from the result of step c) whether or not a
mutation giving rise to drug resistance is present in any of said target
sequences.
La actual invención se relaciona con un método para la detección rápida y confiable de mutaciones droga-seleccionadas en el gene del protease del VIH permitiendo el charaterization simultáneo de una gama de los codons implicados en resistencia de la droga usando sistemas específicos de puntas de prueba optimizadas para funcionar junta en un análisis del reverso-hibridacio'n. Más particularmente, la actual invención se relaciona con un método para determinar la susceptibilidad a las drogas antivirus de los virus del VIH en una muestra biológica, con abarcar dicho del método: a) si sea la necesidad, lanzando, aislando o concentrando los ácidos polynucleic presentes en la muestra; b) si la necesidad esté amplificando la parte relevante del gene del protease del VIH con por lo menos un par conveniente de la cartilla; c) hybrydizing los ácidos polynucleic del paso a) o b) con por lo menos una de las puntas de prueba siguientes: puntas de prueba que cruzan por hibridacio'n específicamente a una secuencia de la blanco que abarca el codon 30; puntas de prueba que cruzan por hibridacio'n específicamente a una secuencia de la blanco que abarca el codon 46 y/o 48; puntas de prueba que cruzan por hibridacio'n específicamente a una secuencia de la blanco que abarca el codon 50; puntas de prueba que cruzan por hibridacio'n específicamente a una secuencia de la blanco que abarca el codon 54; puntas de prueba que cruzan por hibridacio'n específicamente a una secuencia de la blanco que abarca el codon 82 y/o 84; puntas de prueba que cruzan por hibridacio'n específicamente a una secuencia de la blanco que abarca el codon 90; o el complemento de las puntas de prueba dichas; fomente caracterizado en que las puntas de prueba dichas cruzan por hibridacio'n específicamente a cualesquiera de las secuencias de la blanco presentadas en fig. (1), o el complemento de las secuencias dichas de la blanco; d) deduciendo del resultado del paso c) si o no una mutación que da lugar a resistencia de la droga está presente en cualesquiera de las secuencias dichas de la blanco.
