A physics based model of the absorption of light by histological stains
used to measure the amount of one or more stains at locations within
tissue is disclosed. The subsequent analysis results in several
improvements in the detection of tissue on a slide, improvements to
autofocus algorithms so focusing during image acquisition is confined to
tissue, improvements to image segmentation and identification of tissued
and its features, improvements to the identification of stain where
multiple stains are used, and improvements to the quantification of the
extent of staining. The invention relates to the application of these
improvements to stain detection and quantification to provide for
objective comparison between tissues and closer correlation between the
presentations of such features and concurrent patterns of gene or protein
expression.
Una fisica ha basato il modello dell'assorbimento di luce dalle macchie istologiche usate per misurare la quantità di una o più macchie alle posizioni all'interno del tessuto è rilevata. L'analisi successiva provoca parecchi miglioramenti nella rilevazione del tessuto su uno scorrevole, miglioramenti alle procedure di autofocus in modo da mettere a fuoco durante l'aquisizione di immagine è limitata al tessuto, miglioramenti a segmentazione di immagine e l'identificazione di tissued e le relative caratteristiche, miglioramenti all'identificazione di macchia in cui le macchie multiple sono usate e miglioramenti alla quantificazione del limite di macchiatura. L'invenzione riguarda l'applicazione di questi miglioramenti a rilevazione ed a quantificazione della macchia per prevedere il confronto obiettivo fra i tessuti e la correlazione più vicina fra le presentazioni di tali caratteristiche ed i modelli simultanei dell'espressione della proteina o del gene.