Complex multidimensional datasets generated by digital imaging spectroscopy
can be organized and analyzed by applying software and computer-based
methods comprising sorting algorithms. Combinations of these algorithms to
images and graphical data, allow pixels or features to be rapidly and
efficiently classified into meaningful groups according to defined
criteria. Multiple rounds of pixel or feature selection may be performed
based on independent sorting criteria. In one embodiment sorting by
spectral criteria (e.g., intensity at a given wavelength) is combined with
sorting by temporal criteria (e.g., absorbance at a given time) to
identify microcolonies of recombinant organisms harboring mutated genes
encoding enzymes having desirable kinetic attributes and substrate
specificity. Restriction of the set of pixels analyzed in a subsequent
sort based on criteria applied in an earlier sort ("sort and lock"
analyses) minimize computational and storage resources. User-defined
criteria can also be incorporated into the sorting process by means of a
graphical user interface that comprises a visualization tools including a
contour plot, a sorting bar and a grouping bar, an image window, and a
plot window that allow run-time interactive identification of pixels or
features meeting one or more criteria, and display of their associated
spectral or kinetic data. These methods are useful for extracting
information from imaging data in applications ranging from biology and
medicine to remote sensing.
Des ensembles de données multidimensionnels complexes produits par la spectroscopie numérique de formation image peuvent être organisés et analysés en appliquant le logiciel et les méthodes sur ordinateur comportant des algorithmes assortissants. Des combinaisons de ces algorithmes aux images et aux données graphiques, permettent à des Pixel ou à des dispositifs classifier rapidement et efficacement dans les groupes signicatifs s'accordant aux critères définis. Des ronds multiples de la sélection de Pixel ou de mode peuvent être exécutés ont basé sur le indépendant assortissant des critères. Dans une incorporation assortir par les critères spectraux (par exemple, intensité à une longueur d'onde donnée) est combiné avec assortir par des critères temporels (par exemple, absorbance à un moment donné) pour identifier des microcolonies des organizations de recombinaison hébergeant les gènes subis une mutation codant des enzymes ayant des attributs et la spécificité cinétiques souhaitables de substrat. La restriction de l'ensemble de Pixel analysés dans une sorte suivante basée sur des critères s'est appliquée dans une sorte plus tôt (analyses de "sorte et de serrure") réduisent au minimum les ressources informatiques et de stockage. Des critères définis pour l'utilisateur peuvent également être incorporés au processus assortissant au moyen d'une interface utilisateur graphique qui comporte les outils d'une visualisation comprenant une parcelle de terrain de découpe, une barre assortissante et une barre groupante, une fenêtre d'image, et une fenêtre de parcelle de terrain qui permettent l'identification interactive d'exécution des Pixel ou les dispositifs rencontrant un ou plusieurs critères, et affichage de leurs données spectrales ou cinétiques associées. Ces méthodes sont utiles pour extraire l'information à partir des données de formation image dans les applications s'étendant de la biologie et de la médecine à la télédétection.
