The present invention describes a method for identifying one or more of a
plurality of sequences differing by one or more single base changes,
insertions, deletions, or translocations in a plurality of target
nucleotide sequences. The method includes a ligation phase, a capture
phase, and a detection phase. The ligation phase utilizes a ligation
detection reaction between one oligonucleotide probe, which has a target
sequence-specific portion and an addressable array-specific portion, and a
second oligonucleotide probe, having a target sequence-specific portion
and a detectable label. After the ligation phase, the capture phase is
carried out by hybridizing the ligated oligonucleotide probes to a solid
support with an array of immobilized capture oligonucleotides at least
some of which are complementary to the addressable array-specific portion.
Following completion of the capture phase, a detection phase is carried
out to detect the labels of ligated oligonucleotide probes hybridized to
the solid support. The ligation phase can be preceded by an amplification
process. The present invention also relates to a kit for practicing this
method, a method of forming arrays on solid supports, and the supports
themselves.
La presente invenzione descrive un metodo per identificare uno o più di una pluralità di sequenze che differiscono da uno o più singoli cambiamenti, inserzioni, omissioni, o spostamenti bassi in una pluralità di sequenze del nucleotide dell'obiettivo. Il metodo include una fase di ligation, una fase di bloccaggio e una fase di rilevazione. La fase di ligation utilizza una reazione di rilevazione di ligation fra una sonda del oligonucleotide, che ha una parte dell'obiettivo sequence-specifico e una parte accessibile di array-specifico e una seconda sonda del oligonucleotide, avendo una parte dell'obiettivo sequence-specifico e un'etichetta rilevabile. Dopo la fase di ligation, la fase di bloccaggio è effettuata ibridando le sonde legate del oligonucleotide ad un supporto solido con un allineamento dei oligonucleotides immobilizzati di bloccaggio almeno alcuni di cui sia complementare alla parte accessibile di array-specifico. Il completamento seguente della fase di bloccaggio, una fase di rilevazione è effettuato per rilevare le etichette delle sonde legate del oligonucleotide ibridate al supporto solido. La fase di ligation può essere preceduta tramite un processo di amplificazione. La presente invenzione inoltre si riferisce ad un corredo per esercitarsi in questo metodo, in un metodo di formare gli allineamenti sui supporti del solido e nei supporti essi stessi.
