The present invention provides a simplified method for identifying
differences in nucleic acid abundances (e.g., expression levels) between
two or more samples. The methods involve providing an array containing a
large number (e.g. greater then 1,000) of arbitrarily selected different
oligonucleotide probes where the sequence and location of each different
probe is known. Nucleic acid samples (e.g. mRNA) from two or more samples
are hybridized to the probe arrays and the pattern of hybridization is
detected. Differences in the hybridization patterns between the samples
indicates differences in expression of various genes between those
samples. This invention also provides a method o end-labeling a nucleic
acid. In one embodiment, the method involves providing a nucleic acid,
providing a labelled oligonucleotide and then enzymatically ligating the
oligonucleotide to the nucleic acid. Thus, for example, where the nucleic
acid is an RNA, a labeled oligoribonucleotide can be ligated using an RNA
ligase. In another embodiment, the end labelling can be accomplished by
providing a nucleic acid, providing labelled nucleoside triphosphates, and
attaching the nucleoside triphosphates to the nucleic acid using a
terminal transferase.
Присытствыющий вымысел обеспечивает упрощанный метод для определять разницы в abundances нуклеиновой кислоты (например, уровнях выражения) между двумя или несколько образцов. Методы включают предусмотреть блок содержа большой количество (например большие после этого 1.000) произвольно выбранных по-разному зондов олигонуклеотида где знаны последовательность и положение каждого по-разному зонда. Образцы нуклеиновой кислоты (например mRNA) от двух или несколько образцов гибридизированы к блокам зонда и картина гибридизации обнаружена. Разницы в картинах гибридизации между образцами показывают разницы в выражении различных генов между теми образцами. Этот вымысел также обеспечивает метод о конц-oboznaca4 нуклеиновую кислоту. В одном воплощении, метод включает обеспечить нуклеиновую кислоту, обеспечить обозначенный олигонуклеотид и после этого ферментационно перевязать олигонуклеотид к нуклеиновой кислоте. Таким образом, например, где нуклеиновая кислота будет RNA, обозначенное oligoribonucleotide можно перевязать использующ лигазу RNA. В другом воплощении, обозначать конца может быть выполнен путем обеспечивать нуклеиновую кислоту, обеспечивать обозначенные triphosphates нуклеозида, и прикреплять triphosphates нуклеозида к нуклеиновой кислоте использующ терминальную трансферазу.
