An easily automated method of screening for antibiotics active against
erythromycin resistant strains, comprising footprinting an antibiotic on
the domain II of 23S rRNA, isolating rRNA by incubating an antibiotic with
ribosomes, modifying ribosomes with a chemical modifying agent, isolating
modified rRNA and subjecting it to the reverse transcriptase-mediated
primer extension and gel electrophoresis on a DNA sequencer to determine
the extent of antibiotic-induced protection of an rRNA nucleotide from
chemical modification.
Een gemakkelijk geautomatiseerde methode om voor antibiotica te onderzoeken actief tegen erythromycin bestand spanningen, die uit voetafdrukken bestaan een antibioticum op domein II die van 23S rRNA, rRNA isoleert door het uitbroeden van een antibioticum met ribosomen, het wijzigen van ribosomen met een chemische wijzigende agent, gewijzigde rRNA te isoleren en het te onderwerpen aan de omgekeerde transcriptase-bemiddelde van het inleidingsuitbreiding en gel elektroforese op een sequencer van DNA om de omvang van antibiotisch-veroorzaakte bescherming van een nucleotide rRNA van chemische wijziging te bepalen.