A method of searching a database of three-dimensional protein structures. The method comprises the steps of setting a three-dimensional protein structure; forming a two-dimensional binary distance map based on the three-dimensional protein structure; forming a one-dimensional peripheral distribution based on the distance map; and comparing the one-dimensional peripheral distribution of a protein structure with that of another protein structure a dynamic programming algorithm. The method increases detection sensitivity and search speed.

Een methode om een gegevensbestand van driedimensionele eiwitstructuren te zoeken. De methode bestaat uit de stappen van het plaatsen van een driedimensionele eiwitstructuur; vormt een tweedimensionale binaire afstandskaart die op de driedimensionele eiwitstructuur wordt gebaseerd; vormt een ééndimensionale randdistributie die op de afstandskaart wordt gebaseerd; en vergelijkend de ééndimensionale randdistributie van een eiwitstructuur met dat van een andere eiwitstructuur een dynamisch programmeringsalgoritme. De methode verhoogt opsporingsgevoeligheid en onderzoekssnelheid.