Methods and apparatus are provided for the analysis and determination of
the nature of repeat units in a genetic target. In one method of this
invention, the nature of the repeat units in the genetic target is
determined by the steps of providing a plurality of hybridization complex
assays arrayed on a plurality of test sites, where the hybridization
complex assay includes at least a nucleic acid target containing a simple
repetitive DNA sequence, a capture probe having a first unique flanking
sequence and n repeat units, where n=0,1,2 . . . , or fractions thereof,
being complementary to the target sequence, and a reporter probe having a
selected sequence complementary to the same target sequence strand wherein
the selected sequence of the reporter includes a second unique flanking
sequence and m repeat units, where m=0,1,2 . . . , or fractions thereof,
but where the sum of repeat units in the capture probe plus reporter probe
is greater than 0 (n+m>0). Concordance and discordance among the
hybridization complex assays at the test sites is determined at least in
part by hybridization stability. Electronic stringency control may be
utilized. Applications include paternity testing, forensic use, and
disease diagnostics, such as for the identification of the existence of a
clonal tumor.
Methoden und Apparate werden für die Analyse und die Ermittlung der Natur der Wiederholung Maßeinheiten in einem genetischen Ziel zur Verfügung gestellt. In einer Methode dieser Erfindung, wird die Natur der Wiederholung Maßeinheiten im genetischen Ziel durch die Schritte des Zur Verfügung stellens einer Mehrzahl der komplizierten Proben der Hybridation festgestellt, die auf einer Mehrzahl der Testaufstellungsorte gekleidet werden, in denen die komplizierte Probe der Hybridation mindestens ein Nukleinsäureziel einschließt, das eine einfache sich wiederholende DNA Reihenfolge, eine Sicherung Prüfspitze enthält, die eine erste einzigartige angrenzende Reihenfolge und n Wiederholung Maßeinheiten hat, wo n=0,1,2. . . oder Brüche davon, seiend zur Zielreihenfolge und zu einer Reporterprüfspitze ergänzend, die eine vorgewählte Reihenfolge ergänzend zur gleichen Zielreihenfolge Faser hat, worin die vorgewählte Reihenfolge des Reporters eine zweite einzigartige angrenzende Reihenfolge und m Wiederholung Maßeinheiten einschließt, wo m=0,1,2. . . oder Brüche davon, aber, wo die Summe der Wiederholung Maßeinheiten in der Sicherung Prüfspitze plus Reporterprüfspitze grösser als 0 ist (n+m 0). Übereinstimmung und discordance unter den komplizierten Proben der Hybridation an den Testaufstellungsorten wird mindestens im Teil durch Hybridationstabilität festgestellt. Elektronische Strengesteuerung kann verwendet werden. Anwendungen schließen die Vaterschaftprüfung, gerichtlichen Gebrauch und Krankheitdiagnose, wie für die Kennzeichnung des Bestehens eines klonischen Tumors ein.