The present invention provides methods for determining the level of protein
activity in a cell by: (i) measuring abundances of cellular constituents
in a cell in which the activity of a specific protein is to be determined
so that a diagnostic profile is thus obtained; (ii) measuring abundances
of cellular constituents that occur in a cell in response to perturbations
in the activity of said protein to obtain response profiles and
interpolating said response profiles to generate response curves; and
(iii) determining a protein activity level at which the response profile
extracted from the response curves best fits the measured diagnostic
profile, according to some objective measure. In alternative embodiments,
the present invention also provides methods for identifying individuals
having genetic mutations or polymorphisms that disrupt protein activity,
and methods for identifying drug activity in vivo by determining the
activity levels of proteins which interact with said drugs.
La présente invention fournit des méthodes pour déterminer le niveau de l'activité de protéine dans une cellule par : (i) abundances de mesure des constituants cellulaires dans une cellule en laquelle l'activité d'une protéine spécifique doit être déterminée de sorte qu'un profil diagnostique soit ainsi obtenu ; (ii) abundances de mesure des constituants cellulaires qui se produisent dans une cellule en réponse aux perturbations dans l'activité de ladite protéine pour obtenir des profils de réponse et interpoler lesdits profils de réponse pour produire des courbes de réponse ; et (iii) la détermination d'un niveau d'activité de protéine auquel le profil de réponse a extrait à partir des courbes de réponse mieux adapte le profil diagnostique mesuré, selon une certaine mesure objective. Dans des incorporations alternatives, la présente invention fournit également des méthodes pour identifier des individus ayant des mutations ou des polymorphismes qui perturbent l'activité de protéine, et des méthodes génétiques pour identifier l'activité de drogue in vivo en déterminant les niveaux d'activité des protéines qui agissent l'un sur l'autre avec lesdites drogues.
