Methods and compositions are provided for detecting single nucleotide
polymorphisms using a pair of oligonucleotides, a primer and a snp
detection sequence, where the snp detection sequence hybridizes to the
target DNA downstream from the primer and in the direction of primer
extension. The snp detection sequence is characterized by having a
nucleotide complementary to the snp and adjacent nucleotide complementary
to adjacent nucleotides in the target and an electophoretic tag bonded to
the 5'-nucleotide. The pair of oligonucleotides is combined with the
target DNA under primer extension conditions, where the polymerase has
5'-3' exonuclease activity. When the snp is present, the electophoretic
tag is released from the snp detection sequence, and can be detected by
electrophoresis as indicative of the presence of the snp in the target
DNA.
De methodes en de samenstellingen worden verstrekt voor het ontdekken van enig nucleotidepolymorfisme gebruikend een paar van oligonucleotides, een inleiding en een opeenvolging van de snpopsporing, waar de opeenvolging van de snpopsporing stroomafwaarts aan doelcDna van de inleiding en in de richting van inleidingsuitbreiding kruist. De opeenvolging van de snpopsporing wordt gekenmerkt door het hebben van een nucleotide bijkomend aan snp en aangrenzend nucleotide bijkomend aan aangrenzende nucleotiden in het doel en een electophoretic markering in entrepot op het 5'-nucleotide. Het paar oligonucleotides wordt gecombineerd met doelcDna in de omstandigheden van de inleidingsuitbreiding, waar de polymerase 5'-3 ' exonucleaseactiviteit heeft. Wanneer snp aanwezig is, wordt de electophoretic markering vrijgegeven van de opeenvolging van de snpopsporing, en kan door elektroforese worden ontdekt indicatief van de aanwezigheid van snp in doelcDna.