Methods and apparatus are provided for the analysis and determination of
the nature of repeat units in a genetic target. In one method of this
invention, the nature of the repeat units in the genetic target is
determined by the steps of providing a plurality of hybridization complex
assays arrayed on a plurality of test sites, where the hybridization
complex assay includes at least a nucleic acid target containing a simple
repetitive DNA sequence, a capture probe having a first unique flanking
sequence and n repeat units, where n=0,1,2 . . . , or fractions thereof,
being complementary to the target sequence, and a reporter probe having a
selected sequence complementary to the same target sequence strand wherein
the selected sequence of the reporter includes a second unique flanking
sequence and m repeat units, where m=0,1,2 . . . , or fractions thereof,
but where the sum of repeat units in the capture probe plus reporter probe
is greater than 0 (n+m>0). Concordance and discordance among the
hybridization complex assays at the test sites is determined at least in
part by hybridization stability. Electronic stringency control may be
utilized. Applications include paternity testing, forensic use, and
disease diagnostics, such as for the identification of the existence of a
clonal tumor.
Методы и приборы обеспечены для анализа и определения природы блоков повторения в генетической цели. В одном методе этого вымысла, природа блоков повторения в генетической цели обусловлена шагами обеспечивать множественность одетых assays гибридизации сложных на множественности мест испытания, где assay гибридизации сложный вклюает по крайней мере цель нуклеиновой кислоты содержа просто repetitive последовательность ДНАА, зонд захвата имея блоки первой уникально фланкируя последовательности и повторения н, где n=0,1,2. . . , или части thereof, был комплементарны к последовательности цели, и зонду репортера имея выбранную последовательность комплементарную к такой же стренге последовательности цели при котором выбранная последовательность репортера вклюает вторую уникально фланкируя последовательность и блоки повторения м, где m=0,1,2. . . , или части thereof, но где сумма блоков повторения в зонде захвата плюс зонд репортера greater than 0 (n+m 0). Согласование и discordance среди assays гибридизации сложных на местах испытания обусловлены по крайней мере в части стабилностью гибридизации. Электронное управление stringency может быть использовано. Применения вклюают испытывать paternity, судебнохимическая пользу, и диагностику заболеванием, such as для идентификация существования клонового тумора.