Methods for determining the presence of double stranded nucleic acids in a sample are provided. In the subject methods, nucleic acids present in a fluid sample are translocated through a nanopore, e.g. by application of an electric field to the fluid sample. The current amplitude through the nanopore is monitored during the translocation process and changes in the amplitude are related to the passage of single- or double-stranded molecules through the nanopore. The subject methods find use in a variety of applications in which the detection of the presence of double-stranded nucleic acids in a sample is desired, e.g. in hybridization assays, such as Northern blot assays, Southern blot assays, array based hybridization assays, etc.

Los métodos para determinar la presencia de ácidos nucleic trenzados dobles en una muestra se proporcionan. En los métodos sujetos, los ácidos nucleic presentes en una muestra flúida son desplazados a través de un nanopore, e.g. por el uso de un campo eléctrico a la muestra flúida. La amplitud actual a través del nanopore se supervisa durante el proceso del desplazamiento y los cambios en la amplitud se relacionan con el paso de moléculas solas o double-stranded a través del nanopore. Los métodos sujetos encuentran uso en una variedad de usos en los cuales la detección de la presencia de ácidos nucleic double-stranded en una muestra se desee, e.g. en análisis del hibridación, tales como análisis norteños de la mancha blanca /negra, análisis meridionales de la mancha blanca /negra, análisis del hibridación, etc basados arsenal.