Assays for analyzing a sample comprising nucleic acid are described, in
which the sample is contacted with an array comprising a set of
oligonucleotides attached to a solid support at identifiable locations,
wherein each oligonucleotide in the set comprises a label at the distal
end of the oligonucleotide; incubating the contacted array to allow
hybridization of nucleic acid in the sample to the oligonucleotides of the
array; subjecting the hybridized array to a cleavage agent which cleaves
incompletely hybridized oligonucleotides but does not cleave completely
hybridized oligonucleotides; washing the cleaved array; and assessing a
pattern of negative and positive signals on the washed, cleaved array,
wherein a negative signal corresponds to an incompletely hybridized
oligonucleotide that was cleaved by the cleavage agent, thus removing the
label, and a positive signal corresponds to an oligonucleotide that was
not cleaved by the cleavage agent, thus retaining the label.
Los análisis para analizar una muestra que abarca el ácido nucleic se describen, en el cual la muestra se entra en contacto con con un arsenal que abarca un sistema de los oligonucleotides unidos a una ayuda sólida en las localizaciones identificables, en donde cada oligonucleotide en el sistema abarca una etiqueta en el extremo distal del oligonucleotide; incubación del arsenal entrado en contacto con para permitir el hibridación del ácido nucleic en la muestra a los oligonucleotides del arsenal; sujetando el arsenal cruzado por hibridacio'n a un agente de la hendidura que hienda incompleto cruzó los oligonucleotides por hibridacio'n pero no hiende los oligonucleotides totalmente cruzados por hibridacio'n; lavar el arsenal hendido; y determinando un patrón de señales negativas y positivas en haber lavado, el arsenal hendido, en donde una señal negativa corresponde a un oligonucleotide incompleto cruzado por hibridacio'n que fue hendido por el agente de la hendidura, así quitando la etiqueta, y una señal positiva corresponde a un oligonucleotide que no fue hendido por el agente de la hendidura, así conservando la etiqueta.
