An assay to determine the specific expression and suppression of proteins
in response to a stressor is disclosed. An organism exposed to a stressor,
including disease caused by exposure to, e.g., a parasite, or a substance
suspected of causing an adverse effect, is assayed to determine a first
set of proteins expressed and a second set of proteins suppressed in
response to the stressor. The amount of each protein expressed and the
amount of each protein suppressed can be statistically analyzed to
determine which proteins are most useful in diagnosing the stressor. A
protein profile for a first stressor can be compared to protein profiles
for a second stressor, a third stressor, etc. A distinct protein
expression signature (PES) for the first stressor can be identified by
determining subsets fo proteins expressed and/or suppressed only in
response to the first stressor. The quantified set of proteins can then be
used as a template for comparison to the protein expression signature of a
biological sample to determine if the organism has been exposed to the
stressor.
Een analyse wordt om de specifieke uitdrukking en de afschaffing van proteïnen in antwoord op een spanner te bepalen onthuld. Een organisme dat aan een spanner, met inbegrip van ziekte wordt blootgesteld die door blootstelling aan wordt veroorzaakt, b.v., een parasiet, of een substantie verondersteld van het veroorzaken van een ongunstig effect, wordt geanalyseerd om een eerste uitgedrukte reeks proteïnen en een tweede reeks proteïnen te bepalen die in antwoord op de spanner wordt onderdrukt. De uitgedrukte hoeveelheid van elke proteïne en de onderdrukte hoeveelheid van elke proteïne kunnen zijn statistisch geanalyseerd om te bepalen welke proteïnen in het diagnostiseren van de spanner het nuttigst zijn. Een eiwitprofiel voor een eerste spanner kan bij eiwitprofielen voor een tweede spanner, een derde spanner, enz. worden vergeleken. Een verschillende eiwituitdrukkingshandtekening (PES) voor de eerste spanner kan door het bepalen de proteïnen van ondergroepencFo die worden geïdentificeerd slechts in antwoord op de eerste spanner worden uitgedrukt en/of worden onderdrukt. De gekwantificeerde reeks proteïnen kan dan als malplaatje voor vergelijking aan de eiwituitdrukkingsondertekening van een biologische steekproef worden gebruikt om te bepalen als het organisme aan de spanner is blootgesteld.