System and method for automatically processing microarrays

   
   

A digital image processing-based system and method for quantitatively processing a plurality of nucleic acid species expressed in a microarray are disclosed. The microarray is a grid of a plurality of sub-grids of the nucleic acid species. The system includes a scanner that has a digital scanning sensor that scans the microarray and transmits from an output a digital image of the microarray, and a processor that receives the digital image of the microarray from the scanner and then processes the digital image, identifying each of the microarray's sub-grids. The processor then detects in each of the sub-grids a center-representing pixel of a signal of a chemical material and an approximate radius of the signal. Then, the processor segments the signal and calculates a characterizing measure for the segmented signal.

Un sistema procesar-basado y un método de la imagen digital para cuantitativo procesar una pluralidad de especie del ácido nucleic expresada en un microarray se divulgan. El microarray es una rejilla de una pluralidad de secundario-rejillas de la especie del ácido nucleic. El sistema incluye un explorador que tenga un sensor de exploración digital que explore el microarray y transmita de una salida una imagen digital del microarray, y un procesador que reciba la imagen digital del microarray del explorador y después procese la imagen digital, identificando cada uno de las secundario-rejillas de los microarray. El procesador entonces detecta en cada uno de las secundario-rejillas un pixel de centro-representacio'n de una señal de un radio material y aproximado químico de la señal. Entonces, el procesador divide la señal en segmentos y calcula una medida que caracteriza para la señal dividida en segmentos.

 
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