The present invention provides fluorescent nucleoside analogs which comprise a fluorescent cyclic compound joined to a carbon of a sugar molecule such as pentose, hexose, ribose or deoxyribose or analogs thereof in either an .alpha. or .beta. configuration. The subject compounds are useful as probes in the study of the structure and dynamics of nucleic acids and their complexes with proteins. In addition, the subject compounds are useful in any technique which uses labeled oligonucleotides for detection. Non-fluorescent spacer molecules in which a cyclohexane, cyclohexene, decalin, or benzene is joined to a carbon of a sugar moiety such as pentose, hexose, ribose or deoxyribose are also provided. Also provided are the 5' dimethoxytrityl-3'-O-phosphoramidite derivatives, suitable for incorporation into oligonucleotides by automated synthesizers. Combinatorial fluorophore array (CFA) libraries comprising oligomers of the subject nucleoside analogs attached to one or more solid supports are also provided as are methods of selecting fluorophores from the CFA libraries. The present invention also provides oligonucleotide analogs comprising one or more of the subject nucleoside analogs in place of a DNA or RNA base.

La presente invenzione fornisce gli analoghi fluorescenti del nucleoside che contengono un residuo ciclico fluorescente unito ad un carbonio di una molecola dello zucchero quali il pentosio, esosio, ribosio o deoxyribose o analoghi di ciò in il uno o il altro un alpha. o configurazione del beta.. I residui tematici sono utili come le sonde nello studio sulla struttura e sul dynamics degli acidi nucleici e loro complessi con le proteine. In più, i residui tematici sono utili in tutta la tecnica che usa i oligonucleotides identificati per rilevazione. Le molecole non fluorescenti del distanziatore in cui un cicloesano, un cyclohexene, un decalin, o un benzene si unisce ad un carbonio di una parte dello zucchero quale il pentosio, l'esosio, il ribosio o il deoxyribose inoltre sono forniti. Inoltre sono forniti i derivati di 5'dimethoxytrityl-3'-O-phosphoramidite, adatti ad incorporazione nei oligonucleotides dai sintetizzatori automatizzati. Le biblioteche combinatorie di allineamento del fluorophore (CFA) che contengono gli oligomeri gli analoghi tematici del nucleoside fissati ad uno o più supporti solidi inoltre sono fornite come sono metodi di selezione dei fluorophores a partire dalle biblioteche di CFA. La presente invenzione inoltre fornisce gli analoghi del oligonucleotide che contengono uno o più gli analoghi tematici del nucleoside al posto di una base del RNA o del DNA.