Characterization of individual polymer molecules based on monomer-interface interactions

   
   

The invention relates to a method for detecting a double-stranded region in a nucleic acid by (1) providing two separate, adjacent pools of a medium and a interface between the two pools, the interface having a channel so dimensioned as to allow sequential monomer-by-monomer passage of a single-stranded nucleic acid, but not of a double-stranded nucleic acid, from one pool to the other pool; (2) placing a nucleic acid polymer in one of the two pools; and (3) taking measurements as each of the nucleotide monomers of the single-stranded nucleic acid polymer passes through the channel so as to differentiate between nucleotide monomers that are hybridized to another nucleotide monomer before entering the channel and nucleotide monomers that are not hybridized to another nucleotide monomer before entering the channel.

L'invenzione riguarda un metodo per la rilevazione della regione double-stranded in un acido nucleico (1) fornendo due separati, gli stagni adiacenti di un mezzo e un'interfaccia fra i due stagni, l'interfaccia che ha una scanalatura in modo da quotata quanto a permette il passaggio sequenziale del monomero-da-monomero di un acido nucleico singolo-incagliato, ma non di un acido nucleico double-stranded, da uno stagno all'altro stagno; (2) disporre un polimero dell'acido nucleico in uno dei due stagni; e (3) prendendo le misure come ciascuno dei monomeri del nucleotide dei passaggi singolo-incagliati del polimero dell'acido nucleico attraverso la scanalatura in modo da differenziare fra i monomeri del nucleotide che sono ibridati ad un altro monomero del nucleotide prima di entrare nella scanalatura e nei monomeri del nucleotide che non sono ibridati ad un altro monomero del nucleotide prima di entrare nella scanalatura.

 
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